常见以下几种：
　　① 细菌性肠炎。发病机理较为复杂，致病菌借菌毛粘附于肠粘膜上皮细胞,使细菌能在肠壁生长繁殖,成为致病的先决条件。细菌性肠炎的病原菌可分产肠毒素性和侵袭性两大类。不同病原菌引起的肠炎，有不同的发病机理和临床表现。
　　肠毒素性细菌性肠炎。如霍乱，发病机理是致病菌粘附而不侵入肠粘膜，在细菌生长繁殖过程中分泌肠毒素，和小肠粘膜的上皮细胞膜受体结合，激活细胞膜上的腺苷酸环化酶，在该酶的催化下，使细胞内的三磷酸腺苷 (ATP)转化成环磷酸腺苷(cAMP)。当细胞内cAMP的水平升高时，通过一系列的酶反应，使小肠粘膜大量分泌水和电解质,潴留在肠腔内引起水泻,称为“分泌性腹泻”。此类病人除小肠粘膜上皮细胞有分泌亢进外，肠道的病理改变往往没有或者很轻。病原体主要感染小肠，因此基本临床表现是腹泻次数较多，为大量水样便，无脓血，一般无腹痛,无里急后重感,常伴有呕吐，容易发生脱水、电解质紊乱及酸中毒，全身中毒症状较轻。大便镜检常无红、白细胞或极少。
　　侵袭性细菌性肠炎。如细菌性痢疾，致病菌粘附并侵入肠粘膜和粘膜下层，引起明显的炎症。不同的病原菌侵犯肠的部位不同，有的侵犯小肠为主，有的侵犯结肠为主，有的引起小肠和结肠炎症。此类肠炎的基本临床表现是：全身毒血症明显,有高热,重症病人可发生感染性休克。大便可呈粘液脓血便，便量少，便次多。腹痛明显，呈阵发性绞痛。若病变侵及下部结肠特别是直肠，可出现里急后重感。乙状结肠镜检查，可见弥漫性炎症及溃疡。若仅侵袭小肠或上部结肠，则大便含水量较多，不伴里急后重。大便镜检有多数白细胞，尤其是下部结肠炎时更为明显。
　　② 病毒性胃肠炎。见病毒性胃肠炎。
　　③ 寄生虫性肠炎。由原虫和血吸虫引起较为多见。原虫性肠炎中以阿米巴痢疾较多。雅尔氏虫和滴虫均可引起肠炎。血吸虫病在流行地区较为常见，可以表现急性和慢性腹泻、稀便或粘液脓血便。

　　④ 真菌性肠炎。见肠道菌群失调。

　　⑤ 其他